Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOC1P02654 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOC1P02654 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOC1P02654 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOC1P02654 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOC1P02654 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOC1P02654 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOC1P02654 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOC1P02654 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOC1P02654 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOC1P02654 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOC1P02654 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOC1P02654 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOC1P02654 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOC1P02654 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOC1P02654 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOC1P02654 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOC1P02654 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOC1P02654 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOC1P02654 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
APOC1P02654 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOC1P02654 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOC1P02654 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOC1P02654 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOC1P02654 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOC1P02654 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOC1P02654 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOC1P02654 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOC1P02654 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOC1P02654 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOC1P02654 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOC1P02654 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOC1P02654 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOC1P02654 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOC1P02654 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOC1P02654 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOC1P02654 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOC1P02654 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOC1P02654 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOC1P02654 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOC1P02654 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOC1P02654 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOC1P02654 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOC1P02654 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOC1P02654 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOC1P02654 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOC1P02654 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOC1P02654 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOC1P02654 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
APOC1P02654 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOC1P02654 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOC1P02654 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOC1P02654 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOC1P02654 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOC1P02654 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOC1P02654 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOC1P02654 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOC1P02654 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOC1P02654 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOC1P02654 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOC1P02654 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOC1P02654 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOC1P02654 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOC1P02654 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOC1P02654 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOC1P02654 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOC1P02654 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOC1P02654 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOC1P02654 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOC1P02654 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOC1P02654 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOC1P02654 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOC1P02654 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOC1P02654 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOC1P02654 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOC1P02654 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOC1P02654 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOC1P02654 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOC1P02654 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOC1P02654 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOC1P02654 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
APOC1P02654 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOC1P02654 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOC1P02654 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOC1P02654 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOC1P02654 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOC1P02654 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOC1P02654 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOC1P02654 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOC1P02654 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOC1P02654 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOC1P02654 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOC1P02654 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
APOC1P02654 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOC1P02654 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOC1P02654 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOC1P02654 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOC1P02654 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOC1P02654 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOC1P02654 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms