Protein–RNA interactions for Protein: P02100

HBE1, Hemoglobin subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBE1P02100 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HBE1P02100 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
HBE1P02100 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HBE1P02100 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HBE1P02100 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HBE1P02100 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HBE1P02100 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HBE1P02100 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HBE1P02100 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HBE1P02100 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HBE1P02100 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HBE1P02100 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HBE1P02100 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HBE1P02100 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HBE1P02100 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HBE1P02100 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HBE1P02100 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HBE1P02100 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HBE1P02100 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HBE1P02100 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HBE1P02100 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HBE1P02100 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HBE1P02100 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HBE1P02100 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HBE1P02100 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HBE1P02100 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HBE1P02100 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HBE1P02100 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HBE1P02100 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HBE1P02100 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HBE1P02100 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HBE1P02100 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HBE1P02100 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HBE1P02100 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HBE1P02100 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HBE1P02100 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HBE1P02100 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HBE1P02100 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HBE1P02100 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HBE1P02100 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HBE1P02100 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HBE1P02100 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HBE1P02100 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HBE1P02100 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HBE1P02100 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HBE1P02100 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HBE1P02100 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HBE1P02100 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HBE1P02100 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HBE1P02100 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HBE1P02100 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HBE1P02100 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HBE1P02100 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HBE1P02100 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HBE1P02100 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HBE1P02100 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HBE1P02100 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HBE1P02100 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HBE1P02100 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HBE1P02100 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HBE1P02100 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HBE1P02100 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HBE1P02100 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HBE1P02100 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HBE1P02100 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HBE1P02100 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HBE1P02100 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HBE1P02100 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HBE1P02100 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HBE1P02100 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HBE1P02100 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HBE1P02100 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HBE1P02100 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HBE1P02100 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HBE1P02100 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HBE1P02100 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HBE1P02100 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HBE1P02100 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HBE1P02100 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HBE1P02100 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HBE1P02100 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HBE1P02100 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HBE1P02100 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HBE1P02100 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HBE1P02100 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HBE1P02100 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HBE1P02100 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HBE1P02100 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HBE1P02100 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HBE1P02100 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HBE1P02100 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HBE1P02100 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HBE1P02100 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HBE1P02100 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HBE1P02100 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HBE1P02100 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HBE1P02100 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HBE1P02100 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HBE1P02100 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HBE1P02100 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms