Protein–RNA interactions for Protein: O95562

SFT2D2, Vesicle transport protein SFT2B, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D2O95562 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms