Protein–RNA interactions for Protein: O95274

LYPD3, Ly6/PLAUR domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYPD3O95274 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LYPD3O95274 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LYPD3O95274 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LYPD3O95274 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LYPD3O95274 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LYPD3O95274 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LYPD3O95274 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LYPD3O95274 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LYPD3O95274 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LYPD3O95274 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LYPD3O95274 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LYPD3O95274 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LYPD3O95274 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LYPD3O95274 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LYPD3O95274 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LYPD3O95274 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LYPD3O95274 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LYPD3O95274 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LYPD3O95274 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LYPD3O95274 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LYPD3O95274 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LYPD3O95274 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LYPD3O95274 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LYPD3O95274 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LYPD3O95274 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LYPD3O95274 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LYPD3O95274 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LYPD3O95274 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LYPD3O95274 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LYPD3O95274 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LYPD3O95274 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LYPD3O95274 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LYPD3O95274 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LYPD3O95274 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LYPD3O95274 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LYPD3O95274 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LYPD3O95274 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LYPD3O95274 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LYPD3O95274 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LYPD3O95274 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LYPD3O95274 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LYPD3O95274 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LYPD3O95274 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LYPD3O95274 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LYPD3O95274 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LYPD3O95274 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LYPD3O95274 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LYPD3O95274 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LYPD3O95274 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LYPD3O95274 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LYPD3O95274 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LYPD3O95274 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LYPD3O95274 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LYPD3O95274 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LYPD3O95274 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LYPD3O95274 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LYPD3O95274 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LYPD3O95274 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LYPD3O95274 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LYPD3O95274 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LYPD3O95274 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LYPD3O95274 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LYPD3O95274 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LYPD3O95274 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LYPD3O95274 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LYPD3O95274 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LYPD3O95274 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LYPD3O95274 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LYPD3O95274 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LYPD3O95274 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LYPD3O95274 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LYPD3O95274 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LYPD3O95274 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LYPD3O95274 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LYPD3O95274 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LYPD3O95274 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LYPD3O95274 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LYPD3O95274 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LYPD3O95274 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LYPD3O95274 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
LYPD3O95274 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LYPD3O95274 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LYPD3O95274 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LYPD3O95274 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LYPD3O95274 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LYPD3O95274 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LYPD3O95274 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LYPD3O95274 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LYPD3O95274 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LYPD3O95274 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LYPD3O95274 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LYPD3O95274 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LYPD3O95274 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
LYPD3O95274 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LYPD3O95274 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LYPD3O95274 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LYPD3O95274 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LYPD3O95274 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LYPD3O95274 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LYPD3O95274 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms