Protein–RNA interactions for Protein: O75054

IGSF3, Immunoglobulin superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF3O75054 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGSF3O75054 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGSF3O75054 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGSF3O75054 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGSF3O75054 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGSF3O75054 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGSF3O75054 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGSF3O75054 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGSF3O75054 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGSF3O75054 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IGSF3O75054 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IGSF3O75054 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IGSF3O75054 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IGSF3O75054 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IGSF3O75054 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IGSF3O75054 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IGSF3O75054 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IGSF3O75054 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IGSF3O75054 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IGSF3O75054 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
IGSF3O75054 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IGSF3O75054 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IGSF3O75054 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IGSF3O75054 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IGSF3O75054 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IGSF3O75054 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IGSF3O75054 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IGSF3O75054 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
IGSF3O75054 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IGSF3O75054 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IGSF3O75054 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IGSF3O75054 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IGSF3O75054 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IGSF3O75054 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IGSF3O75054 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IGSF3O75054 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IGSF3O75054 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IGSF3O75054 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IGSF3O75054 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IGSF3O75054 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IGSF3O75054 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
IGSF3O75054 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IGSF3O75054 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IGSF3O75054 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IGSF3O75054 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IGSF3O75054 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IGSF3O75054 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IGSF3O75054 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
IGSF3O75054 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IGSF3O75054 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IGSF3O75054 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IGSF3O75054 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IGSF3O75054 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IGSF3O75054 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IGSF3O75054 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IGSF3O75054 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
IGSF3O75054 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IGSF3O75054 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IGSF3O75054 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IGSF3O75054 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IGSF3O75054 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IGSF3O75054 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IGSF3O75054 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IGSF3O75054 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IGSF3O75054 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
IGSF3O75054 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IGSF3O75054 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IGSF3O75054 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IGSF3O75054 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IGSF3O75054 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IGSF3O75054 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IGSF3O75054 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IGSF3O75054 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IGSF3O75054 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IGSF3O75054 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IGSF3O75054 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IGSF3O75054 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IGSF3O75054 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
IGSF3O75054 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IGSF3O75054 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IGSF3O75054 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IGSF3O75054 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IGSF3O75054 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IGSF3O75054 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
IGSF3O75054 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IGSF3O75054 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IGSF3O75054 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IGSF3O75054 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IGSF3O75054 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IGSF3O75054 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IGSF3O75054 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IGSF3O75054 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IGSF3O75054 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
IGSF3O75054 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IGSF3O75054 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
IGSF3O75054 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
IGSF3O75054 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IGSF3O75054 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IGSF3O75054 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IGSF3O75054 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms