Protein–RNA interactions for Protein: O60337

MARCH6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH6O60337 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MARCH6O60337 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms