Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms