Protein–RNA interactions for Protein: O43739

CYTH3, Cytohesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH3O43739 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms