Protein–RNA interactions for Protein: O43426

SYNJ1, Synaptojanin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ1O43426 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
SYNJ1O43426 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
SYNJ1O43426 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SYNJ1O43426 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SYNJ1O43426 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SYNJ1O43426 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
SYNJ1O43426 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SYNJ1O43426 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC34.19■■■■□ 3.06
SYNJ1O43426 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
SYNJ1O43426 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
SYNJ1O43426 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
SYNJ1O43426 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
SYNJ1O43426 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SYNJ1O43426 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SYNJ1O43426 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
SYNJ1O43426 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC34.18■■■■□ 3.06
SYNJ1O43426 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SYNJ1O43426 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
SYNJ1O43426 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
SYNJ1O43426 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
SYNJ1O43426 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
SYNJ1O43426 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
SYNJ1O43426 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
SYNJ1O43426 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
SYNJ1O43426 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
SYNJ1O43426 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
SYNJ1O43426 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
SYNJ1O43426 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
SYNJ1O43426 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
SYNJ1O43426 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
SYNJ1O43426 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
SYNJ1O43426 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC34.16■■■■□ 3.06
SYNJ1O43426 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
SYNJ1O43426 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
SYNJ1O43426 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
SYNJ1O43426 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
SYNJ1O43426 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
SYNJ1O43426 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SYNJ1O43426 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SYNJ1O43426 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
SYNJ1O43426 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SYNJ1O43426 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SYNJ1O43426 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SYNJ1O43426 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SYNJ1O43426 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SYNJ1O43426 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SYNJ1O43426 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SYNJ1O43426 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SYNJ1O43426 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
SYNJ1O43426 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SYNJ1O43426 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
SYNJ1O43426 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
SYNJ1O43426 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SYNJ1O43426 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
SYNJ1O43426 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
SYNJ1O43426 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SYNJ1O43426 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SYNJ1O43426 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SYNJ1O43426 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SYNJ1O43426 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SYNJ1O43426 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
SYNJ1O43426 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SYNJ1O43426 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
SYNJ1O43426 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SYNJ1O43426 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC34.13■■■■□ 3.05
SYNJ1O43426 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
SYNJ1O43426 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
SYNJ1O43426 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
SYNJ1O43426 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
SYNJ1O43426 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
SYNJ1O43426 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SYNJ1O43426 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
SYNJ1O43426 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SYNJ1O43426 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SYNJ1O43426 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SYNJ1O43426 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SYNJ1O43426 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SYNJ1O43426 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SYNJ1O43426 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SYNJ1O43426 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SYNJ1O43426 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SYNJ1O43426 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
SYNJ1O43426 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SYNJ1O43426 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SYNJ1O43426 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SYNJ1O43426 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SYNJ1O43426 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SYNJ1O43426 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SYNJ1O43426 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SYNJ1O43426 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
SYNJ1O43426 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SYNJ1O43426 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SYNJ1O43426 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SYNJ1O43426 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SYNJ1O43426 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
SYNJ1O43426 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SYNJ1O43426 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SYNJ1O43426 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SYNJ1O43426 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SYNJ1O43426 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms