Protein–RNA interactions for Protein: O15015

ZNF646, Zinc finger protein 646, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF646O15015 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF646O15015 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF646O15015 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF646O15015 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF646O15015 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF646O15015 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF646O15015 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF646O15015 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF646O15015 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF646O15015 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF646O15015 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF646O15015 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF646O15015 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF646O15015 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF646O15015 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF646O15015 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF646O15015 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF646O15015 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF646O15015 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF646O15015 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF646O15015 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF646O15015 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF646O15015 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF646O15015 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF646O15015 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF646O15015 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF646O15015 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF646O15015 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF646O15015 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF646O15015 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF646O15015 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF646O15015 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF646O15015 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF646O15015 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF646O15015 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF646O15015 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF646O15015 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF646O15015 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF646O15015 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF646O15015 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF646O15015 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF646O15015 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF646O15015 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF646O15015 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF646O15015 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF646O15015 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF646O15015 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF646O15015 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF646O15015 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF646O15015 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF646O15015 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF646O15015 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF646O15015 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF646O15015 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF646O15015 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF646O15015 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF646O15015 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF646O15015 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF646O15015 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF646O15015 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF646O15015 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF646O15015 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF646O15015 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF646O15015 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF646O15015 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF646O15015 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF646O15015 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF646O15015 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF646O15015 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF646O15015 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF646O15015 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF646O15015 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF646O15015 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF646O15015 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF646O15015 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF646O15015 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF646O15015 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF646O15015 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF646O15015 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF646O15015 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF646O15015 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF646O15015 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF646O15015 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF646O15015 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF646O15015 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF646O15015 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF646O15015 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF646O15015 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF646O15015 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF646O15015 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF646O15015 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF646O15015 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF646O15015 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF646O15015 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF646O15015 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF646O15015 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF646O15015 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF646O15015 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF646O15015 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF646O15015 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms