Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PATL2C9JE40 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PATL2C9JE40 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PATL2C9JE40 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PATL2C9JE40 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PATL2C9JE40 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms