Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C9orf172C9J069 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C9orf172C9J069 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C9orf172C9J069 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C9orf172C9J069 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf172C9J069 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf172C9J069 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf172C9J069 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf172C9J069 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf172C9J069 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf172C9J069 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf172C9J069 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf172C9J069 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf172C9J069 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf172C9J069 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf172C9J069 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf172C9J069 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf172C9J069 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf172C9J069 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf172C9J069 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf172C9J069 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf172C9J069 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf172C9J069 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf172C9J069 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf172C9J069 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf172C9J069 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf172C9J069 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf172C9J069 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf172C9J069 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf172C9J069 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf172C9J069 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf172C9J069 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf172C9J069 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf172C9J069 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf172C9J069 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf172C9J069 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf172C9J069 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf172C9J069 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf172C9J069 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf172C9J069 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf172C9J069 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf172C9J069 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf172C9J069 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf172C9J069 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf172C9J069 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf172C9J069 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf172C9J069 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf172C9J069 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf172C9J069 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf172C9J069 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf172C9J069 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf172C9J069 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf172C9J069 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf172C9J069 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf172C9J069 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf172C9J069 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf172C9J069 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf172C9J069 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf172C9J069 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf172C9J069 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf172C9J069 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C9orf172C9J069 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
C9orf172C9J069 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C9orf172C9J069 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
C9orf172C9J069 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C9orf172C9J069 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C9orf172C9J069 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C9orf172C9J069 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C9orf172C9J069 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C9orf172C9J069 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C9orf172C9J069 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C9orf172C9J069 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
C9orf172C9J069 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
C9orf172C9J069 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
C9orf172C9J069 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms