Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms