Protein–RNA interactions for Protein: A8K8P3

SFI1, Protein SFI1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFI1A8K8P3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFI1A8K8P3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFI1A8K8P3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFI1A8K8P3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFI1A8K8P3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SFI1A8K8P3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFI1A8K8P3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFI1A8K8P3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFI1A8K8P3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFI1A8K8P3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFI1A8K8P3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFI1A8K8P3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SFI1A8K8P3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SFI1A8K8P3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SFI1A8K8P3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SFI1A8K8P3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SFI1A8K8P3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SFI1A8K8P3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SFI1A8K8P3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SFI1A8K8P3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SFI1A8K8P3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SFI1A8K8P3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SFI1A8K8P3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SFI1A8K8P3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SFI1A8K8P3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SFI1A8K8P3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SFI1A8K8P3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SFI1A8K8P3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SFI1A8K8P3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SFI1A8K8P3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SFI1A8K8P3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SFI1A8K8P3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SFI1A8K8P3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SFI1A8K8P3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFI1A8K8P3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFI1A8K8P3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFI1A8K8P3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFI1A8K8P3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFI1A8K8P3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFI1A8K8P3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFI1A8K8P3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFI1A8K8P3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFI1A8K8P3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFI1A8K8P3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SFI1A8K8P3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFI1A8K8P3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFI1A8K8P3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFI1A8K8P3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFI1A8K8P3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFI1A8K8P3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SFI1A8K8P3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SFI1A8K8P3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFI1A8K8P3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFI1A8K8P3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFI1A8K8P3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFI1A8K8P3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFI1A8K8P3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFI1A8K8P3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFI1A8K8P3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFI1A8K8P3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFI1A8K8P3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFI1A8K8P3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFI1A8K8P3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFI1A8K8P3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFI1A8K8P3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFI1A8K8P3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFI1A8K8P3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFI1A8K8P3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFI1A8K8P3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFI1A8K8P3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFI1A8K8P3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFI1A8K8P3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFI1A8K8P3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFI1A8K8P3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFI1A8K8P3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFI1A8K8P3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFI1A8K8P3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFI1A8K8P3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFI1A8K8P3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFI1A8K8P3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFI1A8K8P3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFI1A8K8P3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFI1A8K8P3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFI1A8K8P3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFI1A8K8P3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFI1A8K8P3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFI1A8K8P3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFI1A8K8P3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFI1A8K8P3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFI1A8K8P3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFI1A8K8P3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFI1A8K8P3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFI1A8K8P3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFI1A8K8P3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFI1A8K8P3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFI1A8K8P3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SFI1A8K8P3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFI1A8K8P3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFI1A8K8P3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFI1A8K8P3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms