Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SOBPA7XYQ1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SOBPA7XYQ1 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
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