Protein–RNA interactions for Protein: A6NKL6

TMEM200C, Transmembrane protein 200C, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200CA6NKL6 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM200CA6NKL6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM200CA6NKL6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM200CA6NKL6 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM200CA6NKL6 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM200CA6NKL6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM200CA6NKL6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM200CA6NKL6 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM200CA6NKL6 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM200CA6NKL6 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM200CA6NKL6 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM200CA6NKL6 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM200CA6NKL6 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM200CA6NKL6 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM200CA6NKL6 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM200CA6NKL6 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM200CA6NKL6 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM200CA6NKL6 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM200CA6NKL6 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM200CA6NKL6 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM200CA6NKL6 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM200CA6NKL6 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM200CA6NKL6 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM200CA6NKL6 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM200CA6NKL6 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM200CA6NKL6 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM200CA6NKL6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM200CA6NKL6 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM200CA6NKL6 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM200CA6NKL6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM200CA6NKL6 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM200CA6NKL6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM200CA6NKL6 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM200CA6NKL6 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM200CA6NKL6 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM200CA6NKL6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM200CA6NKL6 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM200CA6NKL6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM200CA6NKL6 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM200CA6NKL6 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM200CA6NKL6 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM200CA6NKL6 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM200CA6NKL6 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM200CA6NKL6 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM200CA6NKL6 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM200CA6NKL6 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM200CA6NKL6 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM200CA6NKL6 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM200CA6NKL6 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM200CA6NKL6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM200CA6NKL6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM200CA6NKL6 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms