Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D6

ARFGEF1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF1Q9Y6D6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARFGEF1Q9Y6D6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARFGEF1Q9Y6D6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARFGEF1Q9Y6D6 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARFGEF1Q9Y6D6 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ARFGEF1Q9Y6D6 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ARFGEF1Q9Y6D6 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ARFGEF1Q9Y6D6 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ARFGEF1Q9Y6D6 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ARFGEF1Q9Y6D6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARFGEF1Q9Y6D6 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARFGEF1Q9Y6D6 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARFGEF1Q9Y6D6 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARFGEF1Q9Y6D6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARFGEF1Q9Y6D6 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARFGEF1Q9Y6D6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARFGEF1Q9Y6D6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARFGEF1Q9Y6D6 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARFGEF1Q9Y6D6 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARFGEF1Q9Y6D6 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARFGEF1Q9Y6D6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARFGEF1Q9Y6D6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARFGEF1Q9Y6D6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARFGEF1Q9Y6D6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARFGEF1Q9Y6D6 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARFGEF1Q9Y6D6 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARFGEF1Q9Y6D6 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARFGEF1Q9Y6D6 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARFGEF1Q9Y6D6 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARFGEF1Q9Y6D6 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARFGEF1Q9Y6D6 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARFGEF1Q9Y6D6 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARFGEF1Q9Y6D6 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARFGEF1Q9Y6D6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARFGEF1Q9Y6D6 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARFGEF1Q9Y6D6 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARFGEF1Q9Y6D6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARFGEF1Q9Y6D6 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARFGEF1Q9Y6D6 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ARFGEF1Q9Y6D6 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARFGEF1Q9Y6D6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARFGEF1Q9Y6D6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARFGEF1Q9Y6D6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARFGEF1Q9Y6D6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARFGEF1Q9Y6D6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARFGEF1Q9Y6D6 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARFGEF1Q9Y6D6 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARFGEF1Q9Y6D6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARFGEF1Q9Y6D6 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARFGEF1Q9Y6D6 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARFGEF1Q9Y6D6 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ARFGEF1Q9Y6D6 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ARFGEF1Q9Y6D6 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ARFGEF1Q9Y6D6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARFGEF1Q9Y6D6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARFGEF1Q9Y6D6 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARFGEF1Q9Y6D6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARFGEF1Q9Y6D6 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARFGEF1Q9Y6D6 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARFGEF1Q9Y6D6 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARFGEF1Q9Y6D6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARFGEF1Q9Y6D6 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARFGEF1Q9Y6D6 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARFGEF1Q9Y6D6 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARFGEF1Q9Y6D6 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARFGEF1Q9Y6D6 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARFGEF1Q9Y6D6 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARFGEF1Q9Y6D6 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ARFGEF1Q9Y6D6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARFGEF1Q9Y6D6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARFGEF1Q9Y6D6 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARFGEF1Q9Y6D6 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARFGEF1Q9Y6D6 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARFGEF1Q9Y6D6 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARFGEF1Q9Y6D6 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ARFGEF1Q9Y6D6 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARFGEF1Q9Y6D6 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARFGEF1Q9Y6D6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFGEF1Q9Y6D6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFGEF1Q9Y6D6 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFGEF1Q9Y6D6 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFGEF1Q9Y6D6 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFGEF1Q9Y6D6 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFGEF1Q9Y6D6 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFGEF1Q9Y6D6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFGEF1Q9Y6D6 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFGEF1Q9Y6D6 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFGEF1Q9Y6D6 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFGEF1Q9Y6D6 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFGEF1Q9Y6D6 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFGEF1Q9Y6D6 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFGEF1Q9Y6D6 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFGEF1Q9Y6D6 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms