Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P4

COL4A3BP, Collagen type IV alpha-3-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A3BPQ9Y5P4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
COL4A3BPQ9Y5P4 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms