Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A8

NFE2L3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2L3Q9Y4A8 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NFE2L3Q9Y4A8 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFE2L3Q9Y4A8 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFE2L3Q9Y4A8 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFE2L3Q9Y4A8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFE2L3Q9Y4A8 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFE2L3Q9Y4A8 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFE2L3Q9Y4A8 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFE2L3Q9Y4A8 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
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