Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms