Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B2

EXOSC1, Exosome complex component CSL4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC1Q9Y3B2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EXOSC1Q9Y3B2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EXOSC1Q9Y3B2 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
EXOSC1Q9Y3B2 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EXOSC1Q9Y3B2 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EXOSC1Q9Y3B2 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EXOSC1Q9Y3B2 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EXOSC1Q9Y3B2 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EXOSC1Q9Y3B2 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EXOSC1Q9Y3B2 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EXOSC1Q9Y3B2 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EXOSC1Q9Y3B2 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EXOSC1Q9Y3B2 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EXOSC1Q9Y3B2 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EXOSC1Q9Y3B2 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EXOSC1Q9Y3B2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EXOSC1Q9Y3B2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EXOSC1Q9Y3B2 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EXOSC1Q9Y3B2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EXOSC1Q9Y3B2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EXOSC1Q9Y3B2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EXOSC1Q9Y3B2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EXOSC1Q9Y3B2 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EXOSC1Q9Y3B2 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EXOSC1Q9Y3B2 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EXOSC1Q9Y3B2 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EXOSC1Q9Y3B2 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EXOSC1Q9Y3B2 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EXOSC1Q9Y3B2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EXOSC1Q9Y3B2 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EXOSC1Q9Y3B2 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EXOSC1Q9Y3B2 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EXOSC1Q9Y3B2 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EXOSC1Q9Y3B2 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EXOSC1Q9Y3B2 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EXOSC1Q9Y3B2 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
EXOSC1Q9Y3B2 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EXOSC1Q9Y3B2 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
EXOSC1Q9Y3B2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EXOSC1Q9Y3B2 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EXOSC1Q9Y3B2 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EXOSC1Q9Y3B2 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EXOSC1Q9Y3B2 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EXOSC1Q9Y3B2 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EXOSC1Q9Y3B2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EXOSC1Q9Y3B2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EXOSC1Q9Y3B2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EXOSC1Q9Y3B2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EXOSC1Q9Y3B2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EXOSC1Q9Y3B2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EXOSC1Q9Y3B2 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EXOSC1Q9Y3B2 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EXOSC1Q9Y3B2 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EXOSC1Q9Y3B2 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EXOSC1Q9Y3B2 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EXOSC1Q9Y3B2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EXOSC1Q9Y3B2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EXOSC1Q9Y3B2 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EXOSC1Q9Y3B2 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EXOSC1Q9Y3B2 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EXOSC1Q9Y3B2 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EXOSC1Q9Y3B2 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EXOSC1Q9Y3B2 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EXOSC1Q9Y3B2 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EXOSC1Q9Y3B2 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EXOSC1Q9Y3B2 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EXOSC1Q9Y3B2 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EXOSC1Q9Y3B2 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EXOSC1Q9Y3B2 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EXOSC1Q9Y3B2 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EXOSC1Q9Y3B2 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EXOSC1Q9Y3B2 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EXOSC1Q9Y3B2 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EXOSC1Q9Y3B2 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EXOSC1Q9Y3B2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EXOSC1Q9Y3B2 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EXOSC1Q9Y3B2 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EXOSC1Q9Y3B2 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EXOSC1Q9Y3B2 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EXOSC1Q9Y3B2 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EXOSC1Q9Y3B2 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EXOSC1Q9Y3B2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EXOSC1Q9Y3B2 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EXOSC1Q9Y3B2 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EXOSC1Q9Y3B2 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
EXOSC1Q9Y3B2 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EXOSC1Q9Y3B2 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EXOSC1Q9Y3B2 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EXOSC1Q9Y3B2 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EXOSC1Q9Y3B2 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EXOSC1Q9Y3B2 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EXOSC1Q9Y3B2 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EXOSC1Q9Y3B2 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EXOSC1Q9Y3B2 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EXOSC1Q9Y3B2 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EXOSC1Q9Y3B2 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EXOSC1Q9Y3B2 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EXOSC1Q9Y3B2 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EXOSC1Q9Y3B2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EXOSC1Q9Y3B2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms