Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I1

NISCH, Nischarin, humanhuman

Predictions only

Length 1,504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCHQ9Y2I1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC47.41■■■■■ 5.18
NISCHQ9Y2I1 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC47.4■■■■■ 5.18
NISCHQ9Y2I1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC47.4■■■■■ 5.18
NISCHQ9Y2I1 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.4■■■■■ 5.18
NISCHQ9Y2I1 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC47.4■■■■■ 5.18
NISCHQ9Y2I1 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC47.4■■■■■ 5.18
NISCHQ9Y2I1 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC47.4■■■■■ 5.18
NISCHQ9Y2I1 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC47.4■■■■■ 5.18
NISCHQ9Y2I1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.39■■■■■ 5.18
NISCHQ9Y2I1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.39■■■■■ 5.18
NISCHQ9Y2I1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC47.39■■■■■ 5.18
NISCHQ9Y2I1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC47.39■■■■■ 5.18
NISCHQ9Y2I1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC47.39■■■■■ 5.18
NISCHQ9Y2I1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.39■■■■■ 5.18
NISCHQ9Y2I1 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC47.39■■■■■ 5.18
NISCHQ9Y2I1 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC47.39■■■■■ 5.18
NISCHQ9Y2I1 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC47.38■■■■■ 5.18
NISCHQ9Y2I1 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC47.38■■■■■ 5.18
NISCHQ9Y2I1 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC47.38■■■■■ 5.18
NISCHQ9Y2I1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.38■■■■■ 5.18
NISCHQ9Y2I1 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC47.38■■■■■ 5.18
NISCHQ9Y2I1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC47.38■■■■■ 5.18
NISCHQ9Y2I1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.38■■■■■ 5.18
NISCHQ9Y2I1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC47.38■■■■■ 5.17
NISCHQ9Y2I1 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC47.37■■■■■ 5.17
NISCHQ9Y2I1 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.37■■■■■ 5.17
NISCHQ9Y2I1 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC47.36■■■■■ 5.17
NISCHQ9Y2I1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.36■■■■■ 5.17
NISCHQ9Y2I1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC47.36■■■■■ 5.17
NISCHQ9Y2I1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC47.36■■■■■ 5.17
NISCHQ9Y2I1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.36■■■■■ 5.17
NISCHQ9Y2I1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.35■■■■■ 5.17
NISCHQ9Y2I1 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC47.35■■■■■ 5.17
NISCHQ9Y2I1 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC47.35■■■■■ 5.17
NISCHQ9Y2I1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.35■■■■■ 5.17
NISCHQ9Y2I1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC47.35■■■■■ 5.17
NISCHQ9Y2I1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.35■■■■■ 5.17
NISCHQ9Y2I1 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC47.35■■■■■ 5.17
NISCHQ9Y2I1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC47.35■■■■■ 5.17
NISCHQ9Y2I1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC47.34■■■■■ 5.17
NISCHQ9Y2I1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC47.34■■■■■ 5.17
NISCHQ9Y2I1 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC47.34■■■■■ 5.17
NISCHQ9Y2I1 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.34■■■■■ 5.17
NISCHQ9Y2I1 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.34■■■■■ 5.17
NISCHQ9Y2I1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC47.34■■■■■ 5.17
NISCHQ9Y2I1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.34■■■■■ 5.17
NISCHQ9Y2I1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC47.34■■■■■ 5.17
NISCHQ9Y2I1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.33■■■■■ 5.17
NISCHQ9Y2I1 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC47.33■■■■■ 5.17
NISCHQ9Y2I1 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC47.33■■■■■ 5.17
NISCHQ9Y2I1 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC47.33■■■■■ 5.17
NISCHQ9Y2I1 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC47.33■■■■■ 5.17
NISCHQ9Y2I1 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC47.33■■■■■ 5.17
NISCHQ9Y2I1 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC47.33■■■■■ 5.17
NISCHQ9Y2I1 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC47.33■■■■■ 5.17
NISCHQ9Y2I1 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC47.33■■■■■ 5.17
NISCHQ9Y2I1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC47.33■■■■■ 5.17
NISCHQ9Y2I1 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC47.32■■■■■ 5.17
NISCHQ9Y2I1 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.32■■■■■ 5.17
NISCHQ9Y2I1 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC47.32■■■■■ 5.17
NISCHQ9Y2I1 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC47.32■■■■■ 5.17
NISCHQ9Y2I1 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.32■■■■■ 5.17
NISCHQ9Y2I1 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC47.32■■■■■ 5.17
NISCHQ9Y2I1 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.32■■■■■ 5.17
NISCHQ9Y2I1 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.32■■■■■ 5.17
NISCHQ9Y2I1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.31■■■■■ 5.16
NISCHQ9Y2I1 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.31■■■■■ 5.16
NISCHQ9Y2I1 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC47.31■■■■■ 5.16
NISCHQ9Y2I1 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC47.31■■■■■ 5.16
NISCHQ9Y2I1 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC47.31■■■■■ 5.16
NISCHQ9Y2I1 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC47.31■■■■■ 5.16
NISCHQ9Y2I1 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC47.31■■■■■ 5.16
NISCHQ9Y2I1 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC47.31■■■■■ 5.16
NISCHQ9Y2I1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.31■■■■■ 5.16
NISCHQ9Y2I1 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC47.31■■■■■ 5.16
NISCHQ9Y2I1 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC47.31■■■■■ 5.16
NISCHQ9Y2I1 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC47.3■■■■■ 5.16
NISCHQ9Y2I1 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC47.3■■■■■ 5.16
NISCHQ9Y2I1 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.3■■■■■ 5.16
NISCHQ9Y2I1 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC47.3■■■■■ 5.16
NISCHQ9Y2I1 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC47.3■■■■■ 5.16
NISCHQ9Y2I1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.3■■■■■ 5.16
NISCHQ9Y2I1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC47.3■■■■■ 5.16
NISCHQ9Y2I1 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC47.29■■■■■ 5.16
NISCHQ9Y2I1 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC47.29■■■■■ 5.16
NISCHQ9Y2I1 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC47.28■■■■■ 5.16
NISCHQ9Y2I1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.28■■■■■ 5.16
NISCHQ9Y2I1 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.28■■■■■ 5.16
NISCHQ9Y2I1 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC47.28■■■■■ 5.16
NISCHQ9Y2I1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC47.28■■■■■ 5.16
NISCHQ9Y2I1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.28■■■■■ 5.16
NISCHQ9Y2I1 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC47.27■■■■■ 5.16
NISCHQ9Y2I1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC47.27■■■■■ 5.16
NISCHQ9Y2I1 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC47.27■■■■■ 5.16
NISCHQ9Y2I1 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC47.27■■■■■ 5.16
NISCHQ9Y2I1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC47.27■■■■■ 5.16
NISCHQ9Y2I1 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC47.26■■■■■ 5.16
NISCHQ9Y2I1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC47.26■■■■■ 5.16
NISCHQ9Y2I1 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC47.26■■■■■ 5.16
NISCHQ9Y2I1 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC47.26■■■■■ 5.16
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