Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HPS5Q9UPZ3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HPS5Q9UPZ3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms