Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU3

SORCS3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS3Q9UPU3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SORCS3Q9UPU3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.33■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms