Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDZRN3Q9UPQ7 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDZRN3Q9UPQ7 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDZRN3Q9UPQ7 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PDZRN3Q9UPQ7 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDZRN3Q9UPQ7 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDZRN3Q9UPQ7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDZRN3Q9UPQ7 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDZRN3Q9UPQ7 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDZRN3Q9UPQ7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDZRN3Q9UPQ7 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDZRN3Q9UPQ7 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDZRN3Q9UPQ7 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDZRN3Q9UPQ7 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDZRN3Q9UPQ7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDZRN3Q9UPQ7 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDZRN3Q9UPQ7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDZRN3Q9UPQ7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDZRN3Q9UPQ7 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDZRN3Q9UPQ7 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDZRN3Q9UPQ7 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PDZRN3Q9UPQ7 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDZRN3Q9UPQ7 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDZRN3Q9UPQ7 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDZRN3Q9UPQ7 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDZRN3Q9UPQ7 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PDZRN3Q9UPQ7 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDZRN3Q9UPQ7 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDZRN3Q9UPQ7 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDZRN3Q9UPQ7 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDZRN3Q9UPQ7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDZRN3Q9UPQ7 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDZRN3Q9UPQ7 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDZRN3Q9UPQ7 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDZRN3Q9UPQ7 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDZRN3Q9UPQ7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDZRN3Q9UPQ7 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDZRN3Q9UPQ7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDZRN3Q9UPQ7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDZRN3Q9UPQ7 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDZRN3Q9UPQ7 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDZRN3Q9UPQ7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDZRN3Q9UPQ7 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDZRN3Q9UPQ7 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PDZRN3Q9UPQ7 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDZRN3Q9UPQ7 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDZRN3Q9UPQ7 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDZRN3Q9UPQ7 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PDZRN3Q9UPQ7 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDZRN3Q9UPQ7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDZRN3Q9UPQ7 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDZRN3Q9UPQ7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDZRN3Q9UPQ7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDZRN3Q9UPQ7 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDZRN3Q9UPQ7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDZRN3Q9UPQ7 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDZRN3Q9UPQ7 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDZRN3Q9UPQ7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDZRN3Q9UPQ7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDZRN3Q9UPQ7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDZRN3Q9UPQ7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDZRN3Q9UPQ7 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDZRN3Q9UPQ7 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDZRN3Q9UPQ7 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDZRN3Q9UPQ7 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDZRN3Q9UPQ7 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDZRN3Q9UPQ7 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PDZRN3Q9UPQ7 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDZRN3Q9UPQ7 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDZRN3Q9UPQ7 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDZRN3Q9UPQ7 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDZRN3Q9UPQ7 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDZRN3Q9UPQ7 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDZRN3Q9UPQ7 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDZRN3Q9UPQ7 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PDZRN3Q9UPQ7 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDZRN3Q9UPQ7 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDZRN3Q9UPQ7 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDZRN3Q9UPQ7 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDZRN3Q9UPQ7 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDZRN3Q9UPQ7 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDZRN3Q9UPQ7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDZRN3Q9UPQ7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDZRN3Q9UPQ7 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDZRN3Q9UPQ7 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDZRN3Q9UPQ7 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDZRN3Q9UPQ7 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDZRN3Q9UPQ7 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDZRN3Q9UPQ7 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDZRN3Q9UPQ7 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDZRN3Q9UPQ7 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDZRN3Q9UPQ7 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDZRN3Q9UPQ7 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDZRN3Q9UPQ7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PDZRN3Q9UPQ7 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDZRN3Q9UPQ7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDZRN3Q9UPQ7 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms