Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX5

ITGA11, Integrin alpha-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA11Q9UKX5 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA11Q9UKX5 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms