Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD1

GMEB2, Glucocorticoid modulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMEB2Q9UKD1 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GMEB2Q9UKD1 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GMEB2Q9UKD1 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GMEB2Q9UKD1 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GMEB2Q9UKD1 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GMEB2Q9UKD1 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GMEB2Q9UKD1 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GMEB2Q9UKD1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GMEB2Q9UKD1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GMEB2Q9UKD1 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GMEB2Q9UKD1 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GMEB2Q9UKD1 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GMEB2Q9UKD1 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GMEB2Q9UKD1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GMEB2Q9UKD1 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GMEB2Q9UKD1 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GMEB2Q9UKD1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GMEB2Q9UKD1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GMEB2Q9UKD1 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GMEB2Q9UKD1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GMEB2Q9UKD1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GMEB2Q9UKD1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GMEB2Q9UKD1 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GMEB2Q9UKD1 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GMEB2Q9UKD1 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GMEB2Q9UKD1 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GMEB2Q9UKD1 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GMEB2Q9UKD1 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GMEB2Q9UKD1 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GMEB2Q9UKD1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GMEB2Q9UKD1 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GMEB2Q9UKD1 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GMEB2Q9UKD1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GMEB2Q9UKD1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GMEB2Q9UKD1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GMEB2Q9UKD1 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GMEB2Q9UKD1 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GMEB2Q9UKD1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GMEB2Q9UKD1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GMEB2Q9UKD1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GMEB2Q9UKD1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GMEB2Q9UKD1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GMEB2Q9UKD1 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GMEB2Q9UKD1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GMEB2Q9UKD1 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GMEB2Q9UKD1 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GMEB2Q9UKD1 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GMEB2Q9UKD1 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GMEB2Q9UKD1 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GMEB2Q9UKD1 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GMEB2Q9UKD1 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GMEB2Q9UKD1 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GMEB2Q9UKD1 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GMEB2Q9UKD1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GMEB2Q9UKD1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GMEB2Q9UKD1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GMEB2Q9UKD1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GMEB2Q9UKD1 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GMEB2Q9UKD1 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GMEB2Q9UKD1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GMEB2Q9UKD1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GMEB2Q9UKD1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GMEB2Q9UKD1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GMEB2Q9UKD1 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GMEB2Q9UKD1 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GMEB2Q9UKD1 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GMEB2Q9UKD1 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GMEB2Q9UKD1 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GMEB2Q9UKD1 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GMEB2Q9UKD1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GMEB2Q9UKD1 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GMEB2Q9UKD1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GMEB2Q9UKD1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GMEB2Q9UKD1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GMEB2Q9UKD1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GMEB2Q9UKD1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GMEB2Q9UKD1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GMEB2Q9UKD1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GMEB2Q9UKD1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GMEB2Q9UKD1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GMEB2Q9UKD1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GMEB2Q9UKD1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GMEB2Q9UKD1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GMEB2Q9UKD1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GMEB2Q9UKD1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GMEB2Q9UKD1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GMEB2Q9UKD1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GMEB2Q9UKD1 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GMEB2Q9UKD1 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GMEB2Q9UKD1 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GMEB2Q9UKD1 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GMEB2Q9UKD1 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GMEB2Q9UKD1 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GMEB2Q9UKD1 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GMEB2Q9UKD1 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GMEB2Q9UKD1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GMEB2Q9UKD1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GMEB2Q9UKD1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GMEB2Q9UKD1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GMEB2Q9UKD1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms