Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK58

CCNL1, Cyclin-L1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1Q9UK58 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCNL1Q9UK58 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCNL1Q9UK58 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCNL1Q9UK58 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCNL1Q9UK58 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCNL1Q9UK58 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCNL1Q9UK58 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCNL1Q9UK58 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCNL1Q9UK58 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCNL1Q9UK58 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCNL1Q9UK58 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCNL1Q9UK58 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCNL1Q9UK58 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCNL1Q9UK58 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCNL1Q9UK58 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCNL1Q9UK58 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCNL1Q9UK58 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCNL1Q9UK58 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCNL1Q9UK58 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCNL1Q9UK58 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCNL1Q9UK58 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CCNL1Q9UK58 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CCNL1Q9UK58 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCNL1Q9UK58 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCNL1Q9UK58 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCNL1Q9UK58 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCNL1Q9UK58 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCNL1Q9UK58 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCNL1Q9UK58 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCNL1Q9UK58 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCNL1Q9UK58 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCNL1Q9UK58 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CCNL1Q9UK58 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCNL1Q9UK58 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCNL1Q9UK58 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCNL1Q9UK58 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCNL1Q9UK58 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCNL1Q9UK58 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCNL1Q9UK58 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCNL1Q9UK58 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCNL1Q9UK58 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCNL1Q9UK58 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCNL1Q9UK58 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCNL1Q9UK58 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCNL1Q9UK58 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCNL1Q9UK58 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCNL1Q9UK58 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCNL1Q9UK58 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCNL1Q9UK58 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCNL1Q9UK58 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCNL1Q9UK58 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCNL1Q9UK58 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCNL1Q9UK58 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCNL1Q9UK58 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCNL1Q9UK58 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCNL1Q9UK58 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCNL1Q9UK58 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCNL1Q9UK58 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCNL1Q9UK58 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCNL1Q9UK58 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCNL1Q9UK58 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCNL1Q9UK58 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCNL1Q9UK58 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCNL1Q9UK58 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCNL1Q9UK58 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCNL1Q9UK58 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCNL1Q9UK58 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCNL1Q9UK58 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCNL1Q9UK58 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCNL1Q9UK58 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCNL1Q9UK58 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCNL1Q9UK58 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCNL1Q9UK58 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCNL1Q9UK58 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCNL1Q9UK58 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCNL1Q9UK58 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCNL1Q9UK58 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCNL1Q9UK58 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCNL1Q9UK58 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCNL1Q9UK58 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCNL1Q9UK58 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCNL1Q9UK58 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCNL1Q9UK58 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCNL1Q9UK58 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCNL1Q9UK58 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCNL1Q9UK58 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCNL1Q9UK58 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCNL1Q9UK58 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCNL1Q9UK58 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCNL1Q9UK58 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCNL1Q9UK58 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCNL1Q9UK58 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCNL1Q9UK58 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCNL1Q9UK58 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCNL1Q9UK58 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCNL1Q9UK58 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCNL1Q9UK58 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCNL1Q9UK58 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCNL1Q9UK58 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCNL1Q9UK58 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms