Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCF2Q9UG63 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCF2Q9UG63 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCF2Q9UG63 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCF2Q9UG63 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCF2Q9UG63 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCF2Q9UG63 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCF2Q9UG63 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCF2Q9UG63 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCF2Q9UG63 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCF2Q9UG63 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCF2Q9UG63 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCF2Q9UG63 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCF2Q9UG63 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCF2Q9UG63 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCF2Q9UG63 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCF2Q9UG63 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCF2Q9UG63 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCF2Q9UG63 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCF2Q9UG63 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCF2Q9UG63 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCF2Q9UG63 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCF2Q9UG63 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCF2Q9UG63 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCF2Q9UG63 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCF2Q9UG63 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCF2Q9UG63 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCF2Q9UG63 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCF2Q9UG63 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCF2Q9UG63 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCF2Q9UG63 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCF2Q9UG63 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCF2Q9UG63 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCF2Q9UG63 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCF2Q9UG63 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCF2Q9UG63 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCF2Q9UG63 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCF2Q9UG63 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCF2Q9UG63 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCF2Q9UG63 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCF2Q9UG63 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCF2Q9UG63 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCF2Q9UG63 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCF2Q9UG63 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCF2Q9UG63 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCF2Q9UG63 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCF2Q9UG63 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCF2Q9UG63 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCF2Q9UG63 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCF2Q9UG63 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCF2Q9UG63 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCF2Q9UG63 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCF2Q9UG63 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCF2Q9UG63 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCF2Q9UG63 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCF2Q9UG63 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCF2Q9UG63 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCF2Q9UG63 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCF2Q9UG63 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCF2Q9UG63 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCF2Q9UG63 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCF2Q9UG63 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCF2Q9UG63 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCF2Q9UG63 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCF2Q9UG63 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCF2Q9UG63 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCF2Q9UG63 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCF2Q9UG63 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCF2Q9UG63 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCF2Q9UG63 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCF2Q9UG63 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCF2Q9UG63 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCF2Q9UG63 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCF2Q9UG63 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCF2Q9UG63 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCF2Q9UG63 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCF2Q9UG63 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABCF2Q9UG63 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABCF2Q9UG63 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABCF2Q9UG63 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms