Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL13Q9P2N7 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms