Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SH3BP4Q9P0V3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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