Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR1

TMOD2, Tropomodulin-2, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD2Q9NZR1 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMOD2Q9NZR1 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMOD2Q9NZR1 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMOD2Q9NZR1 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMOD2Q9NZR1 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMOD2Q9NZR1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMOD2Q9NZR1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMOD2Q9NZR1 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMOD2Q9NZR1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMOD2Q9NZR1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMOD2Q9NZR1 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMOD2Q9NZR1 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMOD2Q9NZR1 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMOD2Q9NZR1 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMOD2Q9NZR1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
TMOD2Q9NZR1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMOD2Q9NZR1 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMOD2Q9NZR1 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMOD2Q9NZR1 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMOD2Q9NZR1 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMOD2Q9NZR1 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMOD2Q9NZR1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMOD2Q9NZR1 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMOD2Q9NZR1 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMOD2Q9NZR1 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TMOD2Q9NZR1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMOD2Q9NZR1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMOD2Q9NZR1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMOD2Q9NZR1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMOD2Q9NZR1 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMOD2Q9NZR1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMOD2Q9NZR1 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMOD2Q9NZR1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMOD2Q9NZR1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMOD2Q9NZR1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMOD2Q9NZR1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMOD2Q9NZR1 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMOD2Q9NZR1 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMOD2Q9NZR1 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMOD2Q9NZR1 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMOD2Q9NZR1 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMOD2Q9NZR1 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMOD2Q9NZR1 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMOD2Q9NZR1 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMOD2Q9NZR1 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMOD2Q9NZR1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMOD2Q9NZR1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMOD2Q9NZR1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMOD2Q9NZR1 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMOD2Q9NZR1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMOD2Q9NZR1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMOD2Q9NZR1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMOD2Q9NZR1 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMOD2Q9NZR1 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMOD2Q9NZR1 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMOD2Q9NZR1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMOD2Q9NZR1 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMOD2Q9NZR1 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMOD2Q9NZR1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMOD2Q9NZR1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMOD2Q9NZR1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMOD2Q9NZR1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMOD2Q9NZR1 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMOD2Q9NZR1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMOD2Q9NZR1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMOD2Q9NZR1 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMOD2Q9NZR1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMOD2Q9NZR1 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMOD2Q9NZR1 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TMOD2Q9NZR1 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMOD2Q9NZR1 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMOD2Q9NZR1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMOD2Q9NZR1 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMOD2Q9NZR1 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMOD2Q9NZR1 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMOD2Q9NZR1 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMOD2Q9NZR1 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMOD2Q9NZR1 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMOD2Q9NZR1 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TMOD2Q9NZR1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMOD2Q9NZR1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMOD2Q9NZR1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMOD2Q9NZR1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMOD2Q9NZR1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMOD2Q9NZR1 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMOD2Q9NZR1 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMOD2Q9NZR1 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMOD2Q9NZR1 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TMOD2Q9NZR1 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMOD2Q9NZR1 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMOD2Q9NZR1 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMOD2Q9NZR1 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMOD2Q9NZR1 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMOD2Q9NZR1 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMOD2Q9NZR1 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMOD2Q9NZR1 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMOD2Q9NZR1 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMOD2Q9NZR1 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMOD2Q9NZR1 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMOD2Q9NZR1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms