Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms