Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA4

MTMR4, Myotubularin-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR4Q9NYA4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MTMR4Q9NYA4 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms