Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY27

PPP4R2, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R2Q9NY27 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPP4R2Q9NY27 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPP4R2Q9NY27 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPP4R2Q9NY27 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPP4R2Q9NY27 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPP4R2Q9NY27 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPP4R2Q9NY27 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPP4R2Q9NY27 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPP4R2Q9NY27 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPP4R2Q9NY27 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPP4R2Q9NY27 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPP4R2Q9NY27 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPP4R2Q9NY27 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPP4R2Q9NY27 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPP4R2Q9NY27 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPP4R2Q9NY27 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPP4R2Q9NY27 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPP4R2Q9NY27 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPP4R2Q9NY27 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPP4R2Q9NY27 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPP4R2Q9NY27 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPP4R2Q9NY27 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPP4R2Q9NY27 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPP4R2Q9NY27 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPP4R2Q9NY27 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPP4R2Q9NY27 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPP4R2Q9NY27 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PPP4R2Q9NY27 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPP4R2Q9NY27 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPP4R2Q9NY27 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPP4R2Q9NY27 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPP4R2Q9NY27 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPP4R2Q9NY27 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPP4R2Q9NY27 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPP4R2Q9NY27 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PPP4R2Q9NY27 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPP4R2Q9NY27 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPP4R2Q9NY27 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPP4R2Q9NY27 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPP4R2Q9NY27 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPP4R2Q9NY27 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PPP4R2Q9NY27 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPP4R2Q9NY27 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPP4R2Q9NY27 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPP4R2Q9NY27 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPP4R2Q9NY27 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPP4R2Q9NY27 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPP4R2Q9NY27 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPP4R2Q9NY27 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPP4R2Q9NY27 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPP4R2Q9NY27 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPP4R2Q9NY27 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPP4R2Q9NY27 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPP4R2Q9NY27 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPP4R2Q9NY27 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPP4R2Q9NY27 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPP4R2Q9NY27 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPP4R2Q9NY27 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPP4R2Q9NY27 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPP4R2Q9NY27 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPP4R2Q9NY27 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPP4R2Q9NY27 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPP4R2Q9NY27 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PPP4R2Q9NY27 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PPP4R2Q9NY27 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PPP4R2Q9NY27 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PPP4R2Q9NY27 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PPP4R2Q9NY27 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PPP4R2Q9NY27 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PPP4R2Q9NY27 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PPP4R2Q9NY27 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PPP4R2Q9NY27 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PPP4R2Q9NY27 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
PPP4R2Q9NY27 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PPP4R2Q9NY27 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPP4R2Q9NY27 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPP4R2Q9NY27 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPP4R2Q9NY27 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PPP4R2Q9NY27 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPP4R2Q9NY27 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPP4R2Q9NY27 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPP4R2Q9NY27 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPP4R2Q9NY27 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPP4R2Q9NY27 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPP4R2Q9NY27 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPP4R2Q9NY27 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPP4R2Q9NY27 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPP4R2Q9NY27 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPP4R2Q9NY27 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPP4R2Q9NY27 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PPP4R2Q9NY27 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPP4R2Q9NY27 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPP4R2Q9NY27 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPP4R2Q9NY27 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPP4R2Q9NY27 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPP4R2Q9NY27 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPP4R2Q9NY27 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPP4R2Q9NY27 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPP4R2Q9NY27 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPP4R2Q9NY27 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms