Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXZ2

DDX43, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX43Q9NXZ2 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDX43Q9NXZ2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDX43Q9NXZ2 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDX43Q9NXZ2 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
DDX43Q9NXZ2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDX43Q9NXZ2 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDX43Q9NXZ2 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDX43Q9NXZ2 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDX43Q9NXZ2 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDX43Q9NXZ2 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDX43Q9NXZ2 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
DDX43Q9NXZ2 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDX43Q9NXZ2 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDX43Q9NXZ2 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDX43Q9NXZ2 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDX43Q9NXZ2 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDX43Q9NXZ2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDX43Q9NXZ2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDX43Q9NXZ2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDX43Q9NXZ2 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDX43Q9NXZ2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDX43Q9NXZ2 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDX43Q9NXZ2 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDX43Q9NXZ2 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDX43Q9NXZ2 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDX43Q9NXZ2 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDX43Q9NXZ2 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
DDX43Q9NXZ2 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDX43Q9NXZ2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDX43Q9NXZ2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDX43Q9NXZ2 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDX43Q9NXZ2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDX43Q9NXZ2 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDX43Q9NXZ2 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDX43Q9NXZ2 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDX43Q9NXZ2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDX43Q9NXZ2 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDX43Q9NXZ2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDX43Q9NXZ2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDX43Q9NXZ2 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDX43Q9NXZ2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDX43Q9NXZ2 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDX43Q9NXZ2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDX43Q9NXZ2 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDX43Q9NXZ2 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDX43Q9NXZ2 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDX43Q9NXZ2 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
DDX43Q9NXZ2 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDX43Q9NXZ2 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDX43Q9NXZ2 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDX43Q9NXZ2 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
DDX43Q9NXZ2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDX43Q9NXZ2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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