Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL9

MCM9, DNA helicase MCM9, humanhuman

Predictions only

Length 1,143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM9Q9NXL9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms