Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DNAJC28Q9NX36 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNAJC28Q9NX36 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms