Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLN6Q9NWW5 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms