Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV12

TMEM140, Transmembrane protein 140, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM140Q9NV12 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms