Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ATG3Q9NT62 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ATG3Q9NT62 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ATG3Q9NT62 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ATG3Q9NT62 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ATG3Q9NT62 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ATG3Q9NT62 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ATG3Q9NT62 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATG3Q9NT62 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATG3Q9NT62 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATG3Q9NT62 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATG3Q9NT62 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATG3Q9NT62 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ATG3Q9NT62 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATG3Q9NT62 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATG3Q9NT62 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATG3Q9NT62 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATG3Q9NT62 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATG3Q9NT62 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ATG3Q9NT62 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ATG3Q9NT62 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATG3Q9NT62 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATG3Q9NT62 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATG3Q9NT62 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATG3Q9NT62 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ATG3Q9NT62 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATG3Q9NT62 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATG3Q9NT62 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATG3Q9NT62 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATG3Q9NT62 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATG3Q9NT62 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATG3Q9NT62 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms