Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNTG1Q9NSN8 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms