Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX3

NDUFA4L2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 4-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA4L2Q9NRX3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NDUFA4L2Q9NRX3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms