Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX3

GPHN, Gephyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHNQ9NQX3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GPHNQ9NQX3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms