Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARFGAP3Q9NP61 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms