Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP58

ABCB6, ATP-binding cassette sub-family B member 6, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB6Q9NP58 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms