Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS5

EPB41L4A, Band 4.1-like protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41L4AQ9HCS5 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EPB41L4AQ9HCS5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EPB41L4AQ9HCS5 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EPB41L4AQ9HCS5 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms