Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7B2

RPF2, Ribosome production factor 2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPF2Q9H7B2 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPF2Q9H7B2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPF2Q9H7B2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPF2Q9H7B2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
RPF2Q9H7B2 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPF2Q9H7B2 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPF2Q9H7B2 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPF2Q9H7B2 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPF2Q9H7B2 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPF2Q9H7B2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPF2Q9H7B2 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPF2Q9H7B2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPF2Q9H7B2 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPF2Q9H7B2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPF2Q9H7B2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPF2Q9H7B2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
RPF2Q9H7B2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPF2Q9H7B2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPF2Q9H7B2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
RPF2Q9H7B2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
RPF2Q9H7B2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPF2Q9H7B2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPF2Q9H7B2 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPF2Q9H7B2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPF2Q9H7B2 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPF2Q9H7B2 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPF2Q9H7B2 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPF2Q9H7B2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPF2Q9H7B2 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPF2Q9H7B2 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPF2Q9H7B2 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPF2Q9H7B2 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPF2Q9H7B2 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPF2Q9H7B2 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPF2Q9H7B2 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPF2Q9H7B2 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPF2Q9H7B2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPF2Q9H7B2 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPF2Q9H7B2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPF2Q9H7B2 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPF2Q9H7B2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
RPF2Q9H7B2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPF2Q9H7B2 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPF2Q9H7B2 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPF2Q9H7B2 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPF2Q9H7B2 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPF2Q9H7B2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPF2Q9H7B2 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPF2Q9H7B2 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPF2Q9H7B2 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPF2Q9H7B2 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPF2Q9H7B2 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPF2Q9H7B2 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPF2Q9H7B2 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPF2Q9H7B2 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPF2Q9H7B2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPF2Q9H7B2 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPF2Q9H7B2 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPF2Q9H7B2 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPF2Q9H7B2 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPF2Q9H7B2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPF2Q9H7B2 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPF2Q9H7B2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPF2Q9H7B2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPF2Q9H7B2 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPF2Q9H7B2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPF2Q9H7B2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPF2Q9H7B2 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPF2Q9H7B2 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPF2Q9H7B2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RPF2Q9H7B2 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RPF2Q9H7B2 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RPF2Q9H7B2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RPF2Q9H7B2 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RPF2Q9H7B2 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPF2Q9H7B2 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPF2Q9H7B2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPF2Q9H7B2 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPF2Q9H7B2 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPF2Q9H7B2 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPF2Q9H7B2 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RPF2Q9H7B2 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPF2Q9H7B2 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPF2Q9H7B2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPF2Q9H7B2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RPF2Q9H7B2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPF2Q9H7B2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPF2Q9H7B2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPF2Q9H7B2 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPF2Q9H7B2 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPF2Q9H7B2 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPF2Q9H7B2 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPF2Q9H7B2 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPF2Q9H7B2 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPF2Q9H7B2 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPF2Q9H7B2 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPF2Q9H7B2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPF2Q9H7B2 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPF2Q9H7B2 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPF2Q9H7B2 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms