Protein–RNA interactions for Protein: Q9H094

NBPF3, Neuroblastoma breakpoint family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3Q9H094 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NBPF3Q9H094 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms