Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I1

MTMR12, Myotubularin-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR12Q9C0I1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTMR12Q9C0I1 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTMR12Q9C0I1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms